Как добавить из дистрибутива то, что вы не поставили в процессе инсталляции системы?
Ну, основные бинарники и конфиги у вас уже стоят. В том числе и ненужные :-).
При инсталляции можно отказатся от установки исходных текстов (src), системы X-Window, игрушек (games), и различной документации (manpages, doc, info, dict).
Кроме того, существует большое колличество дополнительных программ в виде пакетов (packages) и портов (ports). Но о них разговор отдельный. Смотри:
Установка "пакетов" (packages).
Установка "портов" (ports).